個性化生物信息分析
1.全數(shù)據(jù)庫功能富集分析
通過基因組、表觀組、轉錄組、蛋白組等高通量組學檢測可能能夠獲得成百上千的候選差異分子，龐大的數(shù)據(jù)信息給科研工作者進行下游有針對性的分子探索造成極大困難。基于功能數(shù)據(jù)庫富集分析，能夠提供所有信號通路、代謝途徑、生物學事件和功能類別等的統(tǒng)計學顯著性檢驗結果，這些結果直接指引研究人員開展下游驗證工作的先后順序。
本公司通過整合Gene Ontology (GO)、KEGG、Reactome、DisGeNET等多種生物功能數(shù)據(jù)庫，推出“功能數(shù)據(jù)庫富集分析”服務項目，項目報告能反饋直接的下游分子探索方向和可用于文章發(fā)表的圖表，只需要您提供感興趣的基因列表或基因在不同樣品的表達矩陣。此外，也可提供定制化的富集分析服務。
圖：功能數(shù)據(jù)庫富集分析示例
2.轉錄因子/激酶/蛋白互作調控分子預測
轉錄因子和激酶對于基因、蛋白功能的調控至關重要。其中轉錄因子充當著調節(jié)因子，其與廣泛的靶基因結合，控制著細胞類型的決定、發(fā)育模式和疾病進展，通過基于轉錄組差異基因和ChIP-SEQ數(shù)據(jù)庫的相互驗證分析，能夠對上游轉錄調控機制進行深入探索；同樣地，激酶在細胞信號通路及其它重要的細胞過程中起關鍵性調節(jié)作用，因此其與疾病、發(fā)育等密切相關，基于磷酸化蛋白組學的磷酸化位點信息和預測算法，能夠預測催化磷酸肽的上游磷酸激酶。通過蛋白互作網(wǎng)絡分析能夠進一步地鎖定上下游蛋白（基因）的潛在調控關系，有助于從精確鎖定該可行性的疾病機制調控、藥物新靶點等。本公司可提供定制化的上游調控分析服務。
圖：轉錄因子/激酶/蛋白互作預測示例
3.WGCNA共表達網(wǎng)絡構建和Hub靶點篩選
加權基因共表達網(wǎng)絡分析（WGCNA）是基于基因間表達數(shù)據(jù)的相似性來構建基因共表達網(wǎng)絡，不僅可以挖掘高度相關的基因模塊，更可以直觀深入地反映基因之間潛在的表達調控關系以及處于其中核心位置的節(jié)點，即Hub基因。通過WGCNA共表達網(wǎng)絡分析有助于后續(xù)驗證性實驗的迅速開展，并為后續(xù)基因功能的研究提供重要的線索和分析基礎。本公司通過整合WGCNA及相關迭代算法開展項目，您只需要提供基因在不同樣品的表達矩陣（轉錄組、蛋白組、代謝組均可）和表型數(shù)據(jù)（可選），項目報告包含Hub基因功能打分等信息和可用于文章發(fā)表的高水平圖表。此外本公司也可提供定制化的分析和繪圖服務。
4.癌癥數(shù)據(jù)庫挖掘與候選基因篩選?
TCGA、ICGC、GEO等癌癥相關數(shù)據(jù)庫中收集了常見腫瘤的相關組學數(shù)據(jù)，包括轉錄組學、基因組學、表觀遺傳組學等。同時，這些數(shù)據(jù)庫中包含樣本對應的臨床數(shù)據(jù)，包括隨訪時間、腫瘤分期、病理類型等重要信息，通過挖掘組學數(shù)據(jù)和與其關聯(lián)的臨床數(shù)據(jù)，發(fā)現(xiàn)腫瘤發(fā)生、發(fā)展、轉移等根本機制和核心調控分子。您只需要指定感興趣的癌癥類型、數(shù)據(jù)庫以及研究目的，我們挖掘并提供可用于實驗探索、開展課題或基金撰寫使用的素材，如果您有感興趣的基因，我們可通過數(shù)據(jù)挖掘的方式對其關鍵性進行驗證。此外本公司也提供定制化的腫瘤數(shù)據(jù)挖掘分析服務。
5.腫瘤亞型鑒定分析
有效的免疫治療必須建立在更好地了解腫瘤特異性免疫微環(huán)境之上，免疫微環(huán)境異質性會導致免疫檢查點阻斷治療的不同反應?；诨蛐秃突虮磉_模式上的差異，可以鑒定腫瘤亞型間的差異，挖掘與腫瘤臨床預后有關的免疫分子分類器，從而為腫瘤患者的免疫治療提供新的途徑。我們推出的“腫瘤亞型鑒定分析”服務，其關注回答不同腫瘤亞型的分子特征這一重大科學問題，該服務旨在尋找不同亞型根本特征，能夠直接指導后續(xù)的實驗驗證和科學研究工作。
6.生物信息繪圖服務 (火山圖/熱圖/聚類/韋恩圖/桑基圖/網(wǎng)絡圖/Circos圖)
生物信息學分析后往往需要借助清晰直觀的圖片展示分析統(tǒng)計結果，是文章發(fā)表、基金申請、項目書撰寫、學術會議匯報等的重要組成元素。我們推出的個性化繪圖服務只需客戶提交符合標準的結果文件，即可獲得精美的生物信息結果圖，提升科研成果品質，為您的科研工作保駕護航。
